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齿肋赤藓热激蛋白60基因的电子克隆和生物信息学分析/Electronic cloning and characterization of HSP60 gene from Syntrichia caninervis using bioinformatics tool[J]
蔡明; 高贝; 张道远; CAI Ming; GAO Bei; ZHANG Dao-yuan; 中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室,中国科学院新疆生态与地理研究所,新疆乌鲁木齐830011; 中国科学院大学,北京100049
2013
Source Publication生物信息学
Volume11Issue:3Pages:216-223
Abstract用电子克隆方法获得耐旱苔藓齿肋赤藓的热激蛋白60基因,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、结构保守域、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、二级结构、功能域、活性位点、及同源性等方面进行了预测和分析.结果表明:齿肋赤藓热激蛋白60基因全长1841bp,开放阅读框1581bp,编码526个氨基酸残基;编码蛋白含有GroEL保守域,是chaperon-like superfamily家族;亚细胞定位分析显示,编码蛋白位于内质网中;活性化位点分析表明,编码蛋白存在6类活性位点;同源性分析表明,齿肋赤藓热激蛋白60与小立碗藓预测的HSP60同源性最高,达到92%,与卷柏的HSP60次之,同源性达88.83%.研究结果为该基因的实验克隆奠定基础.
Keyword齿肋赤藓 热激蛋白60 电子克隆 生物信息学分析 Syntrichia CanInervis Heat Shock ProteIn 60(Hsp60) In Silico clonIng bioInformatics
Funding Organization国家自然科学基金资助项目 ; 国家自然科学基金资助项目 ; 国家自然科学基金资助项目 ; 国家自然科学基金资助项目
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Language中文
Funding Organization国家自然科学基金资助项目 ; 国家自然科学基金资助项目 ; 国家自然科学基金资助项目 ; 国家自然科学基金资助项目
Document Type期刊论文
Identifierhttp://ir.xjlas.org/handle/365004/13792
Collection研究系统_荒漠环境研究室
Corresponding Author中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室,中国科学院新疆生态与地理研究所,新疆乌鲁木齐830011; 中国科学院大学,北京100049
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GB/T 7714
蔡明,高贝,张道远,等. 齿肋赤藓热激蛋白60基因的电子克隆和生物信息学分析/Electronic cloning and characterization of HSP60 gene from Syntrichia caninervis using bioinformatics tool[J][J]. 生物信息学,2013,11(3):216-223.
APA 蔡明.,高贝.,张道远.,CAI Ming.,GAO Bei.,...&中国科学院大学,北京100049.(2013).齿肋赤藓热激蛋白60基因的电子克隆和生物信息学分析/Electronic cloning and characterization of HSP60 gene from Syntrichia caninervis using bioinformatics tool[J].生物信息学,11(3),216-223.
MLA 蔡明,et al."齿肋赤藓热激蛋白60基因的电子克隆和生物信息学分析/Electronic cloning and characterization of HSP60 gene from Syntrichia caninervis using bioinformatics tool[J]".生物信息学 11.3(2013):216-223.
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